Nat Biotechnol：研究不能重复？确实是HeLa细胞系“变”了

HeLa蛋白质从未在在世界上的许多实验者室培植了近70年，并且长期以来被视为是无限供给的连续性的有所不同蛋白质。然而，2月18日刊出新在《Nature Biotechnology》周报上的一项取而代之研究工作表明，蛋白质在不一定有所不同实验者室彼此间依赖于很大歧异，这引发了对蛋白质则有研究工作比方知道的质疑。“我很高兴看到这项研究工作，但在某种象征意义上我不一定感到困惑，”斯隆史蒂夫琳肝癌里心的分子植物学家Prasad Jallepalli知道，他没有参予这项研究工作。这不一定是HeLa蛋白质则有自诞生以来第一次出新现独特的引述：近来，其他研究工作小组也表明了HeLa蛋白质突逆基底彼此间在等位基因组和RNA表达的显着歧异。这项最取而代之研究工作首次全面分析了各种HeLa突逆基底的遗传突逆（不一定有所不同批次的HeLa蛋白质则有贫困在在世界上的各个实验者室），并且首次表明遗传差异性导致了蛋白表达和表型的改逆。HeLa蛋白质“逆了”？在这项研究工作里，研究工作技术人员从6个发展中国家的13个实验者室采集了14份HeLa样本，并在有所不同的实验者室条件下进行培植。他们首先量化了等位基因拷贝数突逆，揭示了它们等位基因组彼此间的显着歧异。结果发现，HeLa突逆基底彼此间，特别是CCL2和Kyoto突逆基底彼此间依赖于着非常大的差异性。全面的分析表明，许多这些遗传歧异转逆成为mRNA产生的改逆，并且在较小程度上转逆成为蛋白金属量的改逆。研究工作技术人员统计数据知道，HeLa CCL2和Kyoto蛋白质则有的转录组和蛋白组谱彼此彼此间的歧异，就像来自两种不一定有所不同类型组织的癌蛋白质则有彼此间的歧异一样。HeLa突逆基底在培植过程里落叶速度也不一定有所不同，一些蛋白质群并不需要17.5时长才能翻倍，而另一些蛋白质在有所不同的培植条件下并不需要话费超过32时长。它们对沙门氏菌感染的反应也有所不一定有所不同：与其他两种逆基底相比，一种逆基底对感染的敏感性较低，研究工作技术人员将其也许起码的蛋白复合物，这种蛋白复合物在细菌进入宿主蛋白质里起作用。在一项除此以外的实验者里，研究工作小组通过培植蛋白质则有三个月，来观察HeLa突逆基底的等位基因表达是否但会随着时间发生改逆。研究工作技术人员日志了早期蛋白质和后期蛋白质彼此间等位基因表达歧异有约6%。斯图加特联邦理工学院分子则有统生物学研究工作所的Ruedi Aebersell教授是该研究工作的合着者，他知道，“即使在同一个实验者室里，这些蛋白质的歧异和改逆速度也是非常极快的。”他估计，如果一个研究工作生在项目开始时用HeLa蛋白质则有做了一个实验者，并在六个月后被尽快重复这个实验者，他们可能会但会得到不一定有所不同的结果。关于研究工作里的“可复制性能源危机”的提问大多数集里在实验者设计、数据分析层面的缺陷，以及作为主要驱动因素的备受废水或白纸错ID的蛋白质则有。但是Aebersell视为，HeLa蛋白质则有和癌蛋白质则有的生物学歧异可能会是关键。为什么但会“逆”？斯坦福大学的蛋白质植物学家Tim Stearns视为有几个可能会的原因可以推论为什么蛋白质则有在长时间培植下但会发生改逆。首先，HeLa蛋白质是已知等位基因组不稳定的癌蛋白质，因此很可能会随时间随机突逆。此外，它们还但会在实验者室里备受到各种落叶条件的影响，这可能会但会进一步蛋白质进化出新截然不一定有所不同的特质。例如，他知道，灵长类蛋白质的培植包括将其培植到感受到一个培植皿为止，从培植皿里抽取一部分蛋白质，然后将它们摆放在另一个培植皿里落叶，这一过程称为分裂。“每个人做这件事的模式都有点不一定有所不同，”他谈到。最取而代之这些发现，对于人类培植蛋白质的研究工作结果的推论和再现性有一定的象征意义。Aebersell和他的同事在论文里提出新了几个实际的解决方案。首先，研究工作技术人员应该运用于癌蛋白质则有的早期传代，并确保在同一蛋白质则有的不一定有所不同样本里重复同一蛋白质则有的实验者。更加重要的是，植物学家应该清楚地统计数据他们在也就是知道的研究工作里运用于的蛋白质则有突逆基底。